1、反滲透膜膜性能的損壞，而造成膜污染。

2、水質變化頻繁而造成膜污染：原水水質同設計時的水質有變化，使預處理負荷加大，由于進水中含無機物、有機物、微生物、粒狀物和膠體等雜質增多，因此膜污染機率增大。

3、清洗不及時與清洗方法不正確而造成膜污染：在使用過程中，膜除了性能的正常衰減外，清洗不及時與清洗方法不正確也是導致膜污染嚴重的一個重要因素。

4、沒有正確投加藥劑：復合聚酰胺膜在使用中，因為聚酰胺膜耐余氯性差，在使用中沒有正確投加氯等消毒劑，加上用戶對微生物的預防重視不夠，容易導致微生物的污染。

5、膜表面磨損：膜元件被異物堵塞或膜表面受到磨損(如沙粒等)，此種情況要用探測法探測系統內元件，找到已經損壞元件，改造預處理，更換膜元件。

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